7 - 生离死别(主线)
追随父亲的足迹到了废弃的水井杰佛森纪念馆直接进到左测的反应室得到父亲的录音口信#10，得之他为了寻找传说中的辐射文明科技"伊甸园创造模块"GECK，而前往114号避难所寻找它的发明者BRAUN博士[成就20:Scientific Pursuits]..。一路向西来到一个废旧车库底下隐藏的114号掩体，进入会有机器人发制服..。前进坐到"息事宁人仓"里头..。来到了BRAUN博士创造的宁静镇..。画面变成了单色，PIPBOY变成了儿童表。中心公园的小女孩BETTY让你去作恶。1，弄哭男孩，2拆散夫妻，3杀死居民。笔者做了第二个问出父亲就是那条狗，在做第三个时候，一个老太太告诉说她知道自己是在一个醒不来的梦里，去废弃的房间，里头有这个冒充成梦幻仙境的虚拟监狱的故障保险..。进门并无开关。一头雾水。有一些对象可以拨弄发出声音..。仔细听此时的诡异背景音乐..。你会知道这是个隐性的谜语:按照留声机-水杯-玩偶-水杯-盒子-玩偶-可乐瓶的顺序依次按下去，即可接开控制。在终端里启动初始化"中国人入侵"，出门看到宁静镇不再宁静。[成就20:Tranquility Lane]质问博士所有问题，然后离开。
醒来就见到父亲。我问他这是干什么?为什么不辞而别?究竟PROJECT PURIFY有这么重要吗?他说这是他毕生的努力，19年前，也就是我出生时，母亲的离开让他搁置了这个计划，但是他始终无法忘怀。这次是为自己，更是为母亲。我们相约去RIVET CITY寻求李博士帮忙。找到她，一行N人决定前往水站进行实地调研。
父亲会给我一系列的跑腿任务，要跑到水站的地下室，包括修电源，弄计算机。不再赘述。这里可以发现父亲的更多留言记录，其中一则名为"失去的美好"的磁盘里母亲的声音，她的笑让我悲从中来，那是爱我如水，从未得见的母亲。父亲这一生的最爱和最痛。最后上来到管道修水管的时候，英克雷的直升机从天而降。我赶紧从水管另一头赶到主控室。为时已晚。父亲和英克雷的上校和士兵困在实验舱里，英克雷逼父亲交出净水系统，父亲致使系统超载和敌人同归于尽。还不及看他最后一眼，李博士便拉着我离开是非之地..。"我知道一条密道，通往兄弟会的大本营，快!"[成就20:The Waters of Life]
护送一行人一路前行，会遭到两拨每拨6人的英克雷的伏击..。一定要稳扎稳打利用掩体和手雷..。而记得把他们的装甲剥下来扔在地上，即便他们又重又没法穿。消灭掉小股食尸鬼终于来到地面，惊魂未定的李博士大喊LYONS!tmd是我!开门!她真的是经受了太多难以承受。
LYONS长老对这一次袭击不为所动，只是动动嘴皮子，说些安慰的话，他更担忧的是英克雷军。下到实验室和书记员询问GECK的详细资料，他说谁也不敢说那个东西真的存在也没人见过那个东西，让我去避难所科技计算机里查询。地面上的GUNNY骑士可以教我穿动力装甲..。至此终于过渡到了动力装甲+能量武器了。笔者的人物按如此游戏顺序，此时等级14，口才和科技两项技能接近100，仅此参考。如果身上没有携带，现在可以回去检能量装甲。
在兄弟会CITADAL继续转，到数据室避难所终端查询87号避难所的物品清单。GECK赫然在列。回到书记询问，得到87号的地址。另外，A区会议室的GARROW是个寡言少语的人，一名骑士说他们正打赌问出那个无名氏的大号。用口才得到名字:IRVINE，可获得这一笔千元巨款。另外，LAB里的黑人女“星骑士”是一个可招募的NPC。他曾经"护送过"我和父亲。
8 - 故地重游
偶然在MEGATOWN受到101避难所求救的电台信号，是AMADA向我发出的求救。回到老家，发现这里已经是兵荒马乱一片狼籍。我和父亲的出走以及避难所的动乱让地下的居民都跃跃欲试，而洞穴蟒蛇的出走企图遭到了长老的镇压。来到底层见到BUTCH，他请我摧毁101的设施，前进见到AMADA，她请我说服父亲，我告诉她我会适当地处理此事。
来到上层看到OVERSEER，他说无论如何，只要他当长老一天，就要用自己的方式保卫101!我告诉他这一切混乱都是因他的固执而生。而目前，必须要改变。告诉他无论如何这里的人不可能按照"设定"再生活个100年，而这种所谓的用封闭来保持人性的纯净，是不现实的空谈。他开始后悔自己的所作所为，决定把101交由女儿管理。
来到AMADA，告诉她我谈妥此事，她说她不会再阻挡想要走出去的人，但是这里还是他们的家，他们会留守，找到合适的时间，漫漫迁出。她感谢我，但同时要求我永远的离开。感谢你为我，我们做的所有的事情，现在，再见。[成就20:Trouble on the Homefront]临走前回头望看着大铁门滚动着关闭，我想，这是我们最后的谈话么?
注:如果到SUB-LAYER主控室摧毁净水系统，那么人们会一哄而散，AMADA会怒斥我的无义，转身离开。
BUTCH会逃到RIVET CITY，作为一名可招募NPC，可以在低层的酒吧找到他。如果你的声望不会太高的话。
